Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.3
CACNA1CQ13936 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
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