Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
SMAD4Q13485 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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