Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC103833.1-201ENST00000517442 172 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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TCOF1Q13428 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
TCOF1Q13428 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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