Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.54□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01828-202ENST00000450294 955 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC073326.1-201ENST00000451832 557 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
MSLNQ13421 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
MSLNQ13421 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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