Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 GTF2IP20-201ENST00000431663 360 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SGCGQ13326 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.7 ms