Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ANK2-202ENST00000357077 14196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
TRIM28Q13263 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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