Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AL078595.3-201ENST00000623815 1166 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SRSF5Q13243 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 267.4 ms