Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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RPA4Q13156 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
RPA4Q13156 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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