Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
DUSP4Q13115 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
DUSP4Q13115 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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