Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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TRAF3Q13114 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
TRAF3Q13114 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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