Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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TRAF1Q13077 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
TRAF1Q13077 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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