Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
TRDNQ13061 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
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TRDNQ13061 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
TRDNQ13061 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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