Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL157937.1-201ENST00000435092 443 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 PPIAP15-201ENST00000479662 484 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
NFIAQ12857 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
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