Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC079741.1-201ENST00000321498 212 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms