Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC245008.1-201ENST00000608123 476 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 ANKRD36BP1-202ENST00000604892 1417 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 OFD1P4Y-201ENST00000455273 1179 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HOXD13P35453 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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