Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
HOXD10P28358 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
HOXD10P28358 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms