Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.38□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-152P-201ENST00000384037 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.35□□□□□ -2.35
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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