Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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TM6SF1Q9BZW5 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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TM6SF1Q9BZW5 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
TM6SF1Q9BZW5 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
TM6SF1Q9BZW5 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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