Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 ARPC3P5-201ENST00000448802 534 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
SMG1Q96Q15 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC0.14□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
SMG1Q96Q15 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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