Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SAMD8Q96LT4 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms