Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
FAM43BQ6ZT52 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
FAM43BQ6ZT52 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms