Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC074290.1-201ENST00000448883 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SLCO4C1Q6ZQN7 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SLCO4C1Q6ZQN7 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms