Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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CDO1Q16878 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
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CDO1Q16878 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
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CDO1Q16878 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CDO1Q16878 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
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