Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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PTPRNQ16849 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
PTPRNQ16849 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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