Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
TNXAQ16473 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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TNXAQ16473 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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TNXAQ16473 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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TNXAQ16473 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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TNXAQ16473 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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TNXAQ16473 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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TNXAQ16473 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
TNXAQ16473 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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