Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL356266.1-201ENST00000623311 483 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
GABRA6Q16445 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MORN2-203ENST00000409131 544 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AP004247.1-201ENST00000531556 1289 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
GABRA6Q16445 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms