Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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ATP6AP1Q15904 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ATP6AP1Q15904 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ATP6AP1Q15904 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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