Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
VAMP3Q15836 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
VAMP3Q15836 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
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