Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SLC16A10-201ENST00000368850 10051 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
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CNN3Q15417 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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CNN3Q15417 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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CNN3Q15417 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNN3Q15417 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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