Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDCD1Q15116 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms