Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 LINC01422-203ENST00000447149 509 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 PPIAP19-201ENST00000486414 492 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR4310-201ENST00000582950 57 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
LAPTM4AQ15012 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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