Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC006458.1-201ENST00000445093 653 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CHD4Q14839 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CHD4Q14839 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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