Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTTNQ14247 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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