Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 CYCSP33-201ENST00000414485 327 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
COL9A3Q14050 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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