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| NAE1 | Q13564 | SMAD1-AS2-201 | ENST00000508936 | 1090 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA31.1-201 | ENST00000515993 | 133 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA31.5-201 | ENST00000516190 | 133 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP380-201 | ENST00000517190 | 98 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINCR-0001-203 | ENST00000524047 | 545 nt | TSL 4 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | PSMA2P1-201 | ENST00000526365 | 646 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AP000867.2-201 | ENST00000532468 | 320 nt | BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
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| NAE1 | Q13564 | BAZ2B-202 | ENST00000343439 | 2364 nt | TSL 5 BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRDN-201 | ENST00000334268 | 4770 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.05 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | FAM35CP-201 | ENST00000554755 | 2470 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
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| NAE1 | Q13564 | MAPK10-322 | ENST00000641485 | 4530 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTND4P14-201 | ENST00000435799 | 1354 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | PIK3C2G-201 | ENST00000266497 | 4764 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | HSPA4L-202 | ENST00000505726 | 2639 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | IL36B-202 | ENST00000327407 | 1052 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.295-201 | ENST00000364918 | 102 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | IARS-201 | ENST00000375627 | 697 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | DYNLT3P1-201 | ENST00000378574 | 347 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRAJ59-201 | ENST00000390480 | 54 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR888-201 | ENST00000401186 | 77 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AF274573.2-201 | ENST00000437772 | 520 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC092919.1-201 | ENST00000467896 | 229 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
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| NAE1 | Q13564 | AC021242.2-203 | ENST00000521842 | 687 nt | TSL 3 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | HTN3-202 | ENST00000526767 | 578 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL137161.1-201 | ENST00000532231 | 390 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | SARNP-203 | ENST00000552080 | 726 nt | TSL 2 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC068135.2-201 | ENST00000569293 | 1028 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZRANB2-AS2-213 | ENST00000591654 | 719 nt | TSL 5 BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | SRGNP1-201 | ENST00000603392 | 451 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | U2.21-201 | ENST00000637295 | 81 nt | BASIC | 3.04 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | CBLL1-201 | ENST00000222597 | 2003 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIER3-203 | ENST00000381213 | 5198 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | LRRC39-201 | ENST00000342895 | 1881 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | ZMYM2-203 | ENST00000382874 | 10139 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | HDX-201 | ENST00000297977 | 6200 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | PRKACB-219 | ENST00000614872 | 4306 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | Y_RNA.33-201 | ENST00000362591 | 102 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-395P-201 | ENST00000365662 | 106 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORA75B-201 | ENST00000384053 | 137 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU6-1127P-201 | ENST00000384580 | 107 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | SNORD37.1-201 | ENST00000390968 | 65 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNA5SP252-201 | ENST00000391131 | 119 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL606923.1-201 | ENST00000406616 | 190 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC051618.1-201 | ENST00000414295 | 207 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC01675-201 | ENST00000426519 | 701 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC092802.2-202 | ENST00000444665 | 371 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL360271.2-201 | ENST00000447710 | 161 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AL024497.2-201 | ENST00000457081 | 317 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | SCARNA18-201 | ENST00000459004 | 134 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTCO3P38-201 | ENST00000468910 | 766 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | NDUFA6-201 | ENST00000470753 | 475 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | TRBV1-201 | ENST00000476502 | 284 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | RPS29P25-201 | ENST00000481709 | 171 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC106892.1-201 | ENST00000491608 | 406 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC022493.1-201 | ENST00000492984 | 337 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC02061-201 | ENST00000514225 | 335 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | RNU4-29P-201 | ENST00000515943 | 174 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC068880.3-201 | ENST00000519185 | 179 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | CR383656.11-201 | ENST00000552261 | 498 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | LINC01290-201 | ENST00000566787 | 502 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AP001094.1-201 | ENST00000579805 | 193 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR5583-1-201 | ENST00000580941 | 59 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | MIR548AC-201 | ENST00000585049 | 88 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC098617.1-215 | ENST00000594798 | 1152 nt | TSL 5 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC080078.1-201 | ENST00000603643 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | DCAF17-212 | ENST00000611110 | 975 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | C8orf59-208 | ENST00000612809 | 475 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | DISC2.1-201 | ENST00000612827 | 205 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC002553.4-201 | ENST00000616896 | 331 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC073308.1-201 | ENST00000623696 | 305 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| NAE1 | Q13564 | EVI2A-201 | ENST00000247270 | 1860 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.93 | | |
| NAE1 | Q13564 | AC103988.1-201 | ENST00000566382 | 2177 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| NAE1 | Q13564 | NEBL-202 | ENST00000377122 | 9216 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| NAE1 | Q13564 | MTND4P35-201 | ENST00000604257 | 1375 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |