Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TCOF1Q13428 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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