Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL354710.1-201ENST00000453641 246 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
TRIM28Q13263 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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