Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
TRAF3Q13114 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.7 ms