Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
GRIK2Q13002 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
GRIK2Q13002 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms