Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 TPT1P7-201ENST00000458300 517 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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CNTN1Q12860 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CNTN1Q12860 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
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