Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 AL606834.3-201ENST00000602615 496 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STX4Q12846 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
STX4Q12846 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC092001.1-201ENST00000453012 261 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
STX4Q12846 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
STX4Q12846 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL356292.1-201ENST00000283110 373 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
STX4Q12846 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms