Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 NCK1-204ENST00000469404 2403 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHRNEQ04844 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms