Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RPS29P62273 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RPS29P62273 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
RPS29P62273 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
RPS29P62273 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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