Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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PTPRDP23468 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
PTPRDP23468 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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