Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
VPREB1P12018 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
VPREB1P12018 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
VPREB1P12018 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms