Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Vps29Q9QZ88 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vps29Q9QZ88 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms