Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT99

LRRC4B, Leucine-rich repeat-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4BQ9NT99 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRC4BQ9NT99 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LRRC4BQ9NT99 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms