Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
4930513O06RikQ9D549 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms