Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
4933428G20RikQ9D3X4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms