Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CAPNS2Q96L46 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
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